The hlavný rozdiel medzi plazmidom a epizómom je to plazmid sa neintegruje do genómu, zatiaľ čo epizóm sa môže integrovať do genómu. Plazmidy sa tiež vyskytujú hlavne v prokaryotoch, zatiaľ čo v eukaryotoch sa epizómy správajú ako plazmidy v prokaryotoch.

Plazmid a epizóm sú dva typy prvkov DNA, ktoré existujú nezávisle od genómu. Vo všeobecnosti môžu obaja podstúpiť autonómnu replikáciu.

Pokryté kľúčové oblasti

1. Čo je to plazmid - Definícia, štruktúra, dôležitosť 2. Čo je to epizóda - Definícia, štruktúra, dôležitosť 3. Aké sú podobnosti medzi plazmidom a epizódou - Náčrt bežných funkcií 4. Aký je rozdiel medzi plazmidom a epizódou - Porovnanie kľúčových rozdielov

Kľúčové pojmy

Autonómna replikácia, epizód, extrachromozomálne prvky DNA, integrácia do genómu, plazmid

Čo je to plazmid

Plazmid je extrachromozomálny genetický prvok, ktorý sa vyskytuje hlavne v prokaryotoch. Navyše sa môže replikovať nezávisle od genómu. Plazmidy sú spravidla malé kruhové molekuly dvojvláknovej DNA. Navyše neobsahujú gény potrebné na prežitie baktérií. Obsahujú však niektoré gény dôležité pre výber hostiteľa. Ich veľkosť sa môže pohybovať od 1 do 200 kbp. Okrem toho sa počet identických plazmidov môže pohybovať od 1 do 1 000. To znamená, že v tej istej bunke sa môžu vyskytovať rôzne typy plazmidov. Na druhej strane, kvôli autonómnej replikácii sú plazmidy známe ako replikóny. Slúžia ako replikačná jednotka kvôli prítomnosti pôvodu replikácie.

Obrázok 1: Plazmidy

Okrem toho existujú dva typy plazmidov klasifikovaných na základe schopnosti konjugácie. Konjugačné plazmidy spravidla obsahujú sadu prenosových alebo tra génov, ktoré podporujú sexuálnu konjugáciu. Naproti tomu nekonjugačné plazmidy nie sú schopné iniciovať konjugáciu. Okrem toho existuje päť tried plazmidov klasifikovaných podľa funkcie. Patria sem F-plazmidy, ktoré sú schopné konjugácie, R-plazmidy obsahujúce gény pre odolnosť voči antibiotikám, Col plazmidy, obsahujúce gény pre bakteriocíny a proteíny a zabíjajúce iné baktérie, degeneratívne plazmidy umožňujúce trávenie neobvyklých látok a plazmidy virulencie, ktoré sa menia na baktérie na patogény.

Čo je to epizóda

Epizóm je integračný plazmid, ktorý je neesenciálnym extrachromozomálnym genetickým prvkom rovnaký ako plazmidy v prokaryotoch. Plazmidy schopné integrácie do genómu v prokaryotoch sú tiež známe ako epizómy. Integrácia do genómu však umožňuje stabilné zachovanie epizomálnej DNA počas niekoľkých generácií. Ako epizóm slúži napríklad DNA v niektorých vírusoch, ako sú herpesvírusy, adenovírusy a polyomavírusy.

Obrázok 2: Plazmidy vs epizódy

Okrem toho je faktorom F, čo je nekompatibilná skupina plazmidov, ďalší príklad epizómov. Spravidla existuje v troch štátoch. Bunky s autonómnym, extrachromozomálnym stavom sú tu známe ako F.⁺ bunky. Bunky Hfr sú tiež bunky s F faktormi integrovanými do genómu. Na druhej strane, v prvotnom stave F existuje F faktor mimo chromozómu, ale je k nemu pripojená časť chromozomálnej DNA. Epizómy sa navyše dajú odlišovať od iných extrachromozomálnych prvkov svojou veľkou veľkosťou, ktorá je okolo 62 kbp. Epizómy sa tiež môžu autonómne replikovať v cytoplazme. Naproti tomu v eukaryotoch sa epizómy týkajú neintegračného extrachromozomálneho genetického prvku.

Podobnosti medzi plazmidom a epizódou

Rozdiel medzi plazmidom a epizódou

Definícia

Plazmid označuje genetickú štruktúru v bunke, ktorá sa môže replikovať nezávisle od chromozómov, typicky malý kruhový reťazec DNA v cytoplazme prokaryotov, zatiaľ čo epizóm označuje genetický prvok, ktorý sa môže replikovať najmä v spojení s chromozómom, s ktorým sa stáva integrovaný. Toto je hlavný rozdiel medzi plazmidom a epizómom.

Predstavil

Plazmid prvýkrát predstavil Joshua Lederberg v roku 1952, zatiaľ čo epizómiu prvýkrát predstavili François Jacob a Élie Wollman v roku 1958.

Výskyt

Zatiaľ čo plazmidy sa vyskytujú hlavne v prokaryotoch, epizómy sa vyskytujú v prokaryotoch aj eukaryotoch.

Veľkosť

Ďalším rozdielom medzi plazmidom a epizómom je, že plazmidy sú spravidla malé, zatiaľ čo epizómy sú veľké.

Replikácia

Plazmidy sa replikujú autonómne, zatiaľ čo epizómy sa replikujú buď autonómne, alebo v spojení s chromozómom.

Dôležitosť

Plazmidy sa ďalej používajú ako prvok genetickej manipulácie, zatiaľ čo DNA v niektorých lyzogénnych bakteriofágoch funguje ako epizómy, integruje sa do genómu a pretrváva ako profágy.

Záver

Plazmid je v zásade extrachromozomálny genetický prvok, ktorý sa vyskytuje hlavne v prokaryotických bunkách. Spravidla obsahuje gény pre selektívne výhody hostiteľských buniek. Je príznačné, že sa autonómne replikuje v cytoplazme. Na druhej strane je epizóm extrachromozomálnym genetickým prvkom, ktorý sa vyskytuje hlavne v eukaryotoch a v prokaryotoch sa správa ako plazmidy. Hlavnou črtou epizómov je však to, že sa môžu integrovať do genómu na replikáciu a môžu byť úplne vylúčené z bunky. Preto je hlavným rozdielom medzi plazmidom a epizómom ich schopnosť integrovať sa do genómu a ich výskyt.

Referencie:

1. „Epizómy, plazmidy, sekvencie vkladania a transpozóny.“ Svet mikrobiológie a imunológie, Encyclopedia.com, 2019, k dispozícii tu.

Obrázok so súhlasom:

1. „Plasmid (anglicky)“ Od používateľa: Spaully na anglickej wikipédii-vlastná práca (CC BY-SA 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia 2. „Replikácia plazmidu (anglicky)“ Od používateľa: Spaully-vlastná práca (CC BY-SA 2.5) cez Commons Wikimedia