The hlavný rozdiel medzi opravou nesúladu a opravou excízie nukleotidov je to oprava chybného párovania (MMR) je zodpovedná za odstránenie nesprávnych párovania báz a malých inzerčných/delečných slučiek zavedených počas replikácie DNA, zatiaľ čo oprava excízie nukleotidov (NER) je zodpovedná za odstránenie rôznych poškodení DNA, ku ktorým dochádza v dôsledku ultrafialového žiarenia. Bunky sa ďalej podrobia oprave nesúladu bezprostredne po syntéze DNA, zatiaľ čo bunky sa podrobia oprave excízie nukleotidov, ak sa DNA poškodí.

Oprava nezhody a oprava excízie nukleotidov sú dva mechanizmy, ktoré zabraňujú mutáciám a iným trvalým zmenám v sekvencii DNA.

Poškodenie DNA, Oprava DNA, Oprava nezhody (MMR), Oprava nukleotidových excízií (NER), Chyby replikácie

Čo je oprava nesúladu

Oprava nesúladu (MMR) je mechanizmus opravy DNA, ku ktorému dochádza tesne po replikácii DNA. Preto je hlavným cieľom tohto mechanizmu odstrániť a nahradiť nesprávne opravené základne, ktoré nie sú opravené korektúrou. Okrem toho detekuje a opravuje malé inzeráty a delécie, ku ktorým dochádza v dôsledku sklzov DNA polymerázy.

Obrázok 1: Mechanizmus opravy nesúladu

Tri proteíny v systéme na opravu nesúladu E. coli sú zvyčajne MutS, MutL a MutH. Na druhej strane eukaryoty obsahujú iba homológy MutS a MutL. U ľudí sa MutS-homológny heterodimer, MSH2-MSH6 viaže na nesúlad, zatiaľ čo MSH2-MSH6 a MSH2-MSH3 sa môžu viazať na slučku inzercií/delécií. Potom sa novo syntetizovaný reťazec degraduje, čím sa odstráni nesúlad pôsobením EXO1. Potom resyntéza DNA a ligácia dokončí nesúlad.

Čo je to Nucleotide Excision Repair

Oprava nukleotidovej excízie (NER) je opravný mechanizmus DNA na odstránenie a nahradenie poškodených nukleotidov. Tento mechanizmus spravidla detekuje a opravuje poškodenia DNA, ktoré deformujú dvojitú špirálu DNA. To je; táto dráha detekuje nukleotidy a modifikuje sa objemnými chemickými skupinami naviazanými na DNA, ako sú chemikálie v cigaretovom dyme. Ďalej cesta opravy excízie nukleotidov fixuje poškodenia DNA spôsobené UV žiarením. Tu ultrafialové žiarenie spôsobuje, že tymínové a cytozínové bázy reagujú so svojimi susednými nukleotidmi. Výsledné väzby však deformujú dvojitú špirálu, čo spôsobuje chyby v replikácii DNA. Tu sú najbežnejším typom týchto väzieb tymínové diméry, ktoré pozostávajú z dvoch tymínových nukleotidov, ktoré spolu reagujú.

Obrázok 2: Oprava nukleotidovej excízie

Podobnosti medzi opravou nesúladu a opravou nukleotidových excízií

Rozdiel medzi opravou nesúladu a opravou nukleotidových excízií

Definícia

Oprava nesúladu (MMR) sa týka systému opravy DNA, v ktorom sa jeden člen nesprávne priradeného páru báz prevedie na normálne zodpovedajúcu bázu, zatiaľ čo oprava excízie nukleotidov (NER) sa týka hlavnej dráhy, ktorú používajú cicavce na odstránenie objemných lézií DNA, akými sú napr. tvorené ultrafialovým svetlom.

Význam

Bunky prechádzajú opravou nesúladu bezprostredne po syntéze DNA, zatiaľ čo bunky prechádzajú opravou excízie nukleotidov s výskytom poškodenia DNA.

Typ opravy

Oprava nezhody nahrádza nezhody a inzertné/deletačné slučky, ktoré nie sú opravené korektúrou, zatiaľ čo oprava excízie nukleotidov nahrádza poškodenia DNA vytvorené ultrafialovým žiarením alebo chemickými látkami v cigaretovom dyme.

Vyriešenie podľa

Exonukleáza 1 exprimuje nesprávne spárovanú DNA v mechanizme opravy nesúladu, zatiaľ čo transkripčné faktory, XPG a XPF-ERCC1, excidujú poškodenú DNA v mechanizme opravy nukleotidovej excízie.

Záver

Oprava nezhody je mechanizmus opravy DNA, ktorý nahrádza nezhody a slučky inzercie/delécie začlenené počas replikácie DNA. Vo všeobecnosti sú týmito nezhodami uniknuté počas korektúr. Na druhej strane, oprava excízie nukleotidov je ďalším mechanizmom opravy DNA, ktorá nahrádza poškodenú DNA ultrafialovým žiarením. Oprava nesúladu sa preto vyskytuje tesne po replikácii DNA. Mechanizmy opravy excízie nukleotidov sa však vyskytujú s výskytom poškodenia DNA. Hlavnou funkciou oboch mechanizmov je zabrániť mutáciám a iným trvalým zmenám v DNA. Hlavný rozdiel medzi opravou nesúladu a opravou excízie nukleotidov je teda typ opravy.

Referencie:

1. Fleck, O. „Oprava DNA“. Journal of Cell Science, roč. 117, č. 4, 2004, s. 515–517., Doi: 10,1242/jcs.00952.

Obrázok so súhlasom:

1. „Oprava nesúladu DNA Ecoli“ od Kenji Fukui (CC BY 4.0) prostredníctvom Commons Wikimedia 2. „Nucleotide Excision Repair-journal.pbio.0040203.g001“ od Jill O. Fuss, Priscilla K. Cooper (CC BY 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia