Hlavný rozdiel - lentivírus vs. retrovírus

Lentivírus a retrovírus sú dva typy vírusov, ktoré infikujú živé bunky na dokončenie ich životného cyklu. Lentivírus je podtyp retrovírusov. The hlavný rozdiel medzi lentivírusom a retrovírusom je to lentivírus môže infikovať aktívne sa deliace aj nedeliace bunky, zatiaľ čo retrovírusy môžu infikovať iba mitoticky aktívne typy buniek. Lentivírus teda môže infikovať široké spektrum bunkových štádií ako retrovírusy. Lentivírus aj retrovírus sa môžu použiť ako vehikulá, ktoré prenášajú cudzie molekuly DNA do inej bunky. Mechanizmus prenosu DNA sprostredkovaný vírusmi je známy ako transdukcia. Lentivírusy aj retrovírusy sa používajú na opravu defektných génov, ktoré sú zodpovedné za vývoj chorôb.

Pokryté kľúčové oblasti

1. Čo je to lentivírus - Definícia, vlastnosti, typy 2. Čo je to retrovírus - Definícia, vlastnosti, typy 3. Aké sú podobnosti medzi lentivírusom a retrovírusom - Prehľad bežných funkcií 4. Aký je rozdiel medzi lentivírusom a retrovírusom - Porovnanie kľúčových rozdielov

Kľúčové pojmy: HIV, lentivírus, technológia rekombinantnej DNA, retrovírus

Čo je Lentivirus

Lentivírus je typ retrovírusu, ktorý pozostáva z dlhej inkubačnej doby a spôsobuje u zvierat chronické, progresívne a spravidla smrteľné ochorenia. Lentivírusy môžu byť rozdelené do piatich sérotypov na základe typu hostiteľa stavovcov, ktorého infikujú; hovädzí, koňovitý, mačkovitý, ovčí/kozí a primátov. Vírusy ľudskej imunodeficiencie (HIV) typu a 2, opičie (SIV) a mačkovité (FLV) sú príkladmi lentivírusov. Lentivírusy sa používajú na zavedenie veľkých segmentov DNA do bunkovej línie (delenie), primárnych buniek (delenie a nedelenie), neurónových buniek, kmeňových buniek a hematopoetických buniek. Väčšina lentivírusových vektorov je založená na HIV. Štruktúra HIV je znázornená na obrázku 1.

Obrázok 1: HIV

Veľkosť genómu HIV je 9,7 kb. Tri hlavné štruktúrne gény prítomné v genóme sú gag (antigén špecifický pre skupinu), pol (polymeráza) a env (obal). Ostatné regulačné gény sú tat (HIV transaktivátor) a rev (regulátor expresie viriónového proteínu). Okrem toho sú v genóme HIV prítomné aj štyri typy pomocných génov: vif (vírusová infekčnosť), vpr (vírusový proteín R), vpu (vírusový proteín U) a nef (negatívny faktor). Replikácia, integrácia a balenie lentivírusov je sprostredkované cis-pôsobiacimi prvkami lentivírusového genómu.

Čo je retrovírus

Retrovírus je akýkoľvek typ RNA vírusov, ktoré vkladajú kópiu DNA do genómu hostiteľa na replikáciu. Retrovírusy sa vyznačujú svojou schopnosťou reverzne transkribovať svoj genóm RNA do kópie cDNA, ktorú je možné integrovať do genómu hostiteľa. Pozostávajú z dvoch kópií pozitívnych sense molekúl ssRNA v genóme. Retrovírusy môžu byť zaradené do troch podrodín na základe rôznych typov akcesorných a regulačných génov prítomných v genóme. Sú to onkovírusy, lentivírusy a spumavírusy. Onkovírusy sú podľa morfológie subklasifikované do troch kategórií; Typ B, typ C a typ D. Rôzne podskupiny retrovírusov s príkladmi sú popísané v tabuľke 1.

Podrodiny retrovírusov a príklady

Podrodina retrovírusov	Príklady
Oncovírus typu B.	Vírus myšieho prsného nádoru (MMTV)
Oncovírus typu C.	Vírus ľudskej leukémie T-buniek (HTLV), vtáčiu leukózu a sarkómové vírusy (ALSV) a vírus lososového lymfómu
Oncovírus typu D.	Vírus opice Mason-Pfizer (MPMV)
Lentivírusy	Vírusy ľudskej imunodeficiencie (HIV), vírus ovčej maedi-visna (MVV) a vírus infekčnej anémie koní (EIAV)
Spumavírusy	Opičie penivé vírusy (SFV)

Retrovírusy pozostávajú z enzýmu reverznej transkriptázy na reverznú transkripciu genómu RNA. Štrukturálne a enzymatické proteíny, ako sú kapsid (CA), nukleokapsid (NC), integráza (IN) a proteáza (PR), sú umiestnené vo vnútri retrovírusového kompartmentu.

Obrázok 2: Mechanizmus infekcie HIV

Vnútorné jadro retrovírusu je obklopené vonkajšou proteínovou vrstvou, ktorá pozostáva z matricového (MA) proteínu. Obal retrovírusu je odvodený z membrány hostiteľskej bunky. Retrovírusy infikujú deliace sa bunkové línie a primárne bunky, kmeňové bunky a krvotvorné bunky.

Podobnosti medzi lentivírusom a retrovírusom

Rozdiel medzi lentivírusom a retrovírusom

Definícia

Lentivírus: Lentivírus je typ retrovírusu, ktorý pozostáva z dlhej inkubačnej doby a spôsobuje u zvierat chronické, progresívne a spravidla smrteľné ochorenia.

Retrovírus: Retrovírus je akýkoľvek typ RNA vírusu, ktorý vkladá kópiu DNA do genómu hostiteľa na replikáciu.

Typy infekčných buniek

Lentivírus: Lentivírus môže infikovať aktívne deliace aj nedeliace sa bunky.

Retrovírus: Retrovírusy môžu infikovať iba mitoticky aktívne typy buniek.

Druhy

Lentivírus: Lentivírus je typ retrovírusov.

Retrovírus: Tri typy retrovírusov sú onkovírusy, lentivírusy a spumavírusy.

Rozsah

Lentivírus: Lentivírus môže infikovať široké spektrum bunkových štádií.

Retrovírus: Retrovírus môže infikovať úzky rozsah bunkových štádií.

Veľkosť genómu

Lentivírus: Veľkosť lentivírusového genómu divokého typu je 9,7 kb.

Retrovírus: Veľkosť retrovírusového genómu divokého typu je 8,3 kb.

Gény príslušenstva

Lentivírus: Lentivírusy pozostávajú z pomocných génov v ich genóme.

Retrovírus: Niektorým retrovírusom, ako sú onkovírusy, chýbajú pomocné gény.

Záver

Lentivírus a retrovírus sú dva typy vírusov, ktoré infikujú živé bunky. Lentivírus je typ retrovírusov. Lentivírus aj retrovírus sa používajú v technológii rekombinantnej DNA na zavedenie porovnateľne veľkých cudzích segmentov DNA do živočíšnych buniek. Lentivírus môže infikovať deliace sa aj nedeliace sa bunky, retrovírusy však môžu infikovať iba deliace sa bunky. Toto je hlavný rozdiel medzi lentivírusom a retrovírusom.

Referencia:

1. O'Keefe, Eric P. „Dodávka nukleovej kyseliny: lentivírusové a retrovírusové vektory“. Materiály a metódy, 15. júna 2015, K dispozícii tu.

Obrázok so súhlasom:

1. „HI-Virion-en“ Národným zdravotným ústavom USA (prekreslil en: Užívateľ: Carl Henderson)-Americký národný inštitút zdravia (prekreslil en: Užívateľ: Carl Henderson) (Public Domain) cez Commons Wikimedia 2. „Hiv brutto“ Preložil Raul654-Pôvodne z obrázku GFDL Obrázok: Hiv gross german.png (CC BY-SA 3.0) cez Commons Wikimedia