Hlavný rozdiel - cDNA vs genómová DNA

Komplementárna DNA (cDNA) a genómová DNA sú dva typy molekúl DNA používané vo výskumných experimentoch v molekulárnej biológii. CDNA aj genómová DNA sú tvorené DNA nukleotidmi. cDNA je produkovaná reverznou transkripciou extrahovanej RNA z tkaniva. Typy RNA použité na reverznú transkripciu môžu byť celková RNA, pre-mRNA, RNA, ribozomálna RNA alebo tRNA. Genómovú DNA je však možné z bunky izolovať priamo. The hlavný rozdiel medzi cDNA a genómovou DNA je to cDNA predstavuje transkriptóm konkrétneho organizmu, zatiaľ čo genómová genómová DNA predstavuje genóm.

Pokryté kľúčové oblasti

1. Čo je cDNA - Definícia, fakty, rola 2. Čo je to genómová DNA - Definícia, fakty, rola 3. Aké sú podobnosti medzi cDNA a genómovou DNA - Prehľad bežných funkcií 4. Aký je rozdiel medzi cDNA a genómovou DNA - Porovnanie kľúčových rozdielov

Kľúčové pojmy: komplementárna DNA (cDNA), genóm, genómová DNA (gDNA), reverzná transkripcia, RNA, transkriptóm

Čo je cDNA

cDNA (komplementárna DNA) sa týka syntetickej DNA, ktorej sekvencie báz sú komplementárne k DNA. Vyrába sa z reverznej transkripcie templátov RNA. Na reverznú transkripciu je možné použiť celkovú RNA, pre-mRNA, RNA, ribozomálnu RNA alebo tRNA. Reverzná transkriptáza je enzým, ktorý katalyzuje reakciu produkcie cDNA z RNA. Reverzná transkripcia spojená s PCR je znázornená na obrázku 1.

Obrázok 1: Reverzná transkripcia spojená s PCR

cDNA sa používa hlavne na klonovanie eukaryotických génov v prokaryotických genómoch. Exóny pozostávajú z kódujúcej oblasti proteínov. V eukaryotoch je kódujúca oblasť prerušená intrónmi. Počas transkripcie sú intróny aj exóny kódované do pre-mRNA. Ale počas spracovania mRNA sú intróny odstránené z mRNA, čím vzniká zrelá mRNA spojením exónov dohromady. Celková mRNA organizmu sa nazýva transkriptóm. Prokaryotom však chýbajú mechanizmy spracovania mRNA. MRNA sa teda používa na syntézu cDNA, ktorá obsahuje iba oblasti kódujúce proteín genómu. Táto cDNA sa používa na klonovanie génov do prokaryotov. cDNA sa prirodzene vyrába v retrovírusoch počas konverzie genómu RNA na DNA.

Čo je to genómová DNA

Genomická DNA (gDNA) sa týka celého súboru chromozomálnej DNA v genóme. Celkový súbor génov konkrétneho organizmu sa označuje ako jeho genóm. Aktívne však nie sú iba gény genómu. Väčšina skupín organizmov má v rámci skupiny podobné typy genómovej DNA. Genóm organizmu sa prenáša z ďalšej generácie na druhú. Genómy sú spravidla tvorené veľkým počtom párov báz. Napríklad ľudský genóm pozostáva z približne 3 miliárd párov báz. Chromozómy ľudského genómu sú znázornené na obrázku 2.

Obrázok 2: Chromozómy ľudského genómu

Štyrmi druhmi sekvencií nachádzajúcich sa v genómovej DNA sú gény kódujúce proteíny, tandemovo sa opakujúce gény, opakujúce sa DNA a spacer DNA. Genomická DNA sa používa v mnohých experimentoch v molekulárnej biológii. Izolácia genómovej DNA je jednoduchá v porovnaní s prípravou cDNA. Genomickú DNA je možné použiť ako templáty PCR na klonovanie, sekvenovanie, prípravu genómových knižníc, snímanie odtlačkov prstov DNA, štúdium štruktúr génov a detekciu mutácií/abnormalít.

Podobnosti medzi cDNA a genómovou DNA

Rozdiel medzi cDNA a genómovou DNA

Definícia

cDNA: cDNA je syntetická DNA, ktorej sekvencie báz sú komplementárne k genómovej DNA.

Genomická DNA: Genomická DNA je celkový súbor chromozomálnych DNA v genóme.

Zástupca

cDNA: cDNA predstavuje transkriptóm.

Genomická DNA: DNA predstavuje genóm.

Syntetizované/extrahované z

cDNA: cDNA je syntetizovaná z reverznej transkripcie rôznych typov RNA.

Genomická DNA: Genomickú DNA je možné extrahovať z existujúcich genómov.

Obsah

cDNA: cDNA pozostáva z exónov alebo kódujúcich oblastí.

Genomická DNA: Genomická DNA pozostáva z kódujúcich a nekódujúcich sekvencií organizmu.

Množstvo

cDNA: cDNA obsahuje niekoľko párov báz.

Genomická DNA: Genomická DNA obsahuje veľký počet párov báz.

Použite

cDNA: cDNA sa používa na produkciu knižníc cDNA.

Genomická DNA: Genomická DNA sa môže použiť na výrobu genómových knižníc.

Záver

cDNA a genómová DNA sú dva typy molekúl DNA používané v rôznych typoch experimentov v molekulárnej biológii. cDNA je syntetizovaná z RNA a pozostáva iba z exónov. Preto predstavuje transkriptóm organizmu. Genomickú DNA je možné ľahko extrahovať z jadra bunky. Skladá sa z kódujúcich aj nekódujúcich oblastí. Predstavuje genóm konkrétneho organizmu. Hlavným rozdielom medzi cDNA a genómovou DNA je typ DNA prítomný v každom type molekúl DNA.

Referencia:

1. „CDNA (komplementárna DNA)“. Ľudské gény, dostupné tu.2. „GDNA - genómová DNA | Advanced Analytical (AATI). “ Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), k dispozícii tu. "Izolácia a aplikácie genómovej DNA." Scribd, k dispozícii tu.

Obrázok so súhlasom:

1. „Reverzná transkripčná polymerázová reťazová reakcia“ Autor: Jpark623-vlastná práca (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia2. „Ľudský genóm ku génom“ (CC BY 2.0) prostredníctvom Commons Wikimedia